As linhas de investigação do Grupo de Genómica Animal e Bioinformática incidem no uso de tecnologia de sequenciação e genotipagem de última geração para estudar a regulação e arquitetura genética de características quantitativas de importância económica. As atividades incidem principalmente nas espécies zootécnicas de maior relevância, como os suínos, bovinos e pequenos ruminantes (ovinos e caprinos). O objetivo principal é identificar marcadores moleculares associados com desempenhos produtivos superiores, para utilização em programas de seleção genética e/ou genómica.

Atualmente o grupo tem projetos, em várias fases de progresso, que incidem sobre a identificação e desenvolvimento de marcadores moleculares para características produtivas de interesse económico em suínos e resistência a doenças (peeira e parasitas gastrointestinais) em ovinos. Uma vez que as raças de animais estudadas são, na sua maioria, raças autóctones Portuguesas o grupo está também a desenvolver novos métodos e tecnologias para a rastreabilidade dos animais destas raças, assim como a traçabilidade dos produtos típicos que são produzidos com base nelas.

Estão também a decorrer vários projetos em plantas, que incluem a identificação de marcadores genéticos em pinheiro manso, a sequenciação do genoma do sobreiro, e o desenvolvimento de marcadores moleculares para o melhoramento de variedades de trigo com base em seleção genómica. Outros projetos em plantas incluem a análise transcriptómica da resistência a vários fatores abióticos, como o estresse térmico e hídrico, em trigo e em sobreiro. 

Membros do Grupo

Ana Usié (CV)   Investigadora                        Doutorada em Bioinformática                       Universidade de Lleida     ana.usie@cebal.pt   Tel: +351 284314399   Ext: 02049

Daniel Gaspar (CV)   Estudante de doutoramento   Mestre em Bioinformática e Biologia Computacional   Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa      daniel.gaspar@cebal.pt   Tel: +351 284314399   Ext: 01107

Ex-membros do Grupo

Marcos Ramos, Investigador Principal (Jan. 205 - Jul. 2021)

Hugo Magalhães, Mestre (Fev. 2017 - Aug. 2020)

Marta Antunes, Mestre (Dec. 2017 - Aug. 2020)

Bruna Mendes, Mestre (Apr. 2019 - May. 2020)

Célia Leão, Post-Doc (Fev. 2017 - Jun. 2019)

Brigida de Meireles, Mestre (Oct. 2015 - Nov. 2018)

Pedro Barbosa, Mestre (Nov. 2014 - Aug. 2017)

Inés Chaves, Post-Doc

Projetos em curso

2023 -  SOS_PRODEHESAMONTADO: Modelos de sostenibilidad integral y resiliencia de la dehesa-montado frente a las amenazas climáticas (POCTEP - 0086_SOS_Prodehesamontado_4_E)

Projetos Concluídos

2016 – 2021: SelectPorAl: “Seleção e melhoramento genómico de características produtivas do Porco Alentejano” (ALENTEJO2020 - Refª ALT20-03-0145-FEDER-000032). Coordenação.

2016 – 2021: SelecTEcoli - Seleção e caracterização de estirpes de E. coli com tolerância acrescida a multi-inibidores derivados dos processos de pré-tratamento da biomassa lenhocelulósica (ALENTEJO2020 - Refª ALT20-03-0145-FEDER-000034).

2017 – 2020: INNOACE – Innovación abierta e inteligente en la EUROACE. Actividad 2 - Ación 2. Tarea 7. Propuestas para una gestión eficiente de la fertilización en plantaciones frutales de regadío en la zona Alentejo-Extremadura” (POCTEP).

2016 – 2020: GEN-RES-ALENTEJO - Utilização da genómica para apoio à seleção de ovinos resistentes a parasitoses e peeira no Alentejo (ALENTEJO2020 - Refª ALT20-03-0145-FEDER-000037)

2016 – 2020: SelectPinea: “Desenvolvimento de marcadores genéticos para características de interesse em pinheiro manso (Pinus pinea)” (ALT20-03-0145-FEDER-000041)

2016 – 2019: FASTBREED - implementação de um programa de melhoramento de variedades de trigo com base em seleção genómica (ALENTEJO2020 - Refª ALT20-03-0145-FEDER-000018)

2015 - 2019: Lentidev: Uma abordagem molecular da cortiça à porosidade da cortiça” (ALT20-03-0145-FEDER-000020)

2013 – 2019: Genetic characterization of national animal and plant resources using next-generation sequencing (Investigador FCT project IF/00574/2012/CP1209/CT0001). Coordenação.

2012 – 2015: “Genosuber - Sequenciação do genoma do sobreiro” ALENT-07-0224-FEDER-001754

Publicações recentes

Artigos em revistas de circulação internacional com revisão por pares

D. Gaspar, C. Trindade, A. Usié, B. Meireles, A. M. Fortes, J. Guimarães, F. Simões, R. Costa, A. M. Ramos (2020). Comparative transcriptomic response of two Pinus species to infection with the pine wood nematode Bursaphelenchus xylophilus. Forests 2020, 11(2), 204; https://doi.org/10.3390/f11020204

Capote, T., Usié, A., Barbosa P., Ramos, A.M., Morais-Cecílio, L. and Gonçalves, S. 2. (2019). Transcriptome dynamics of cork oak (Quercus suber) somatic embryogenesis reveals active gene players in transcriptome regulation and phytohormone homeostasis of embryo development. Tree Genetics & Genomes, 15: 52. https://doi.org/10.1007/s11295-019-1353-6

Capote, T., Barbosa, P., Usié, A., Ramos, A.M., Inácio, V., Ordás, R., Gonçalves, S. and Morais-Cecílio, L. (2018). Chip-Seq reveals that QsMYB1 directly targets genes involved in ligning and subering biosynthesis pathways in cork oak (Quercus suber). BMC Plant Biology 2018 Sep 17; 18(1):198.

Ramos , A.M., Usié, A., Barbosa, P., Barros, P.M., Capote, T., Chaves, I., Simões, F., Abreu, I., Carrasquinho, I., Faro, C., Guimarães, J.B., Mendonça, D., Nóbrega, F., Rodrigues, L., Saibo, N., Varela, M.C., Egas, C., Matos, J., Miguel, C.M., Oliveira, M.M., Ricardo, C.P., Gonçalves, S.. (2018). The draft genome sequence of cork oak. Scientific Data, 5, 180069.

B. Meireles, A. Usié, P. Barbosa, A.M. Fortes, A. Folgado. I. Chaves, I. Carrasquinho, R.L. Costa, S. Gonçalves, R.T. Teixeira, A.M. Ramos, F. Nóbrega (2018) Characterization of the cork formation and production transcriptome in Quercus cerris × suber hybrids. Physiology and Molecular Biology of Plants, pp 1-15, doi:10.1007/s12298-018-0526-3

A. Usié, F. Simões, P. Barbosa, B. Meireles, I. Chaves, S. Gonçalves, A. Folgado  M.H. Almeida, J. Matos and A.M. Ramos (2017). Comprehensive Analysis of the Cork Oak (Quercus suber) Transcriptome Involved in the Regulation of Bud Sprouting. Forests, vol 8. No. 12. 486, doi:10.3390/f8120486

P. Barbosa, C. Leão, A Usié, A. Amaro, A. Botelho, C. Pinto, J. Inácio, K. Stevenson and A.M. Ramos (2017) Draft Genome Sequence of a Rare Pigmented Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis Type C Strain. Genome Announcements, 5(41), e01066–17. http://doi.org/10.1128/genomeA.01066-17

D. Gaspar, C. Trinidade, A. Usié, B. Meireles, P. Barbosa, A. Fortes, C. Pesquita, R. Costa and A.M. Ramos (2017) Expression Profiling in Pinus Pinaster in Response to Infection with the Pine Wood Nematode Bursaphelenchus xylophilus. Forests, vol 9. No. 8. 279, doi: 10.3390/f8080279

Oral presentations

Ramos, A.M. (2016). Development of genetic markers for economically important traits in the Alentejano pig. 2016 X Iberian Congress on Animal Genetic Resources, Castelo Branco, Portugal, 15-17 September

Ramos, A.M., Genosuber Consortium (2016). The draft assembly and annotation of the cork oak (Quercus suber L.) genome. 5th Bioinformatics Open Days, Braga, Portugal, 18-19 February

Ramos, A.M. (2015). Genetic biomarkers for the traceability of animal products. 1^st National Symposium “Biomarkers in Animal Science and Veterinary Sciences: An Interdisciplinary Approach”, Évora, Portugal, 31 March

Ramos, A.M., Genosuber Consortium (2015). The draft assembly and annotation of the cork oak (Quercus suber L.) genome. Fisiologia Vegetal, XXI Meeting of the Spanish Society of Plant Physiology, XIV Iberian Meeting of Plant Physiology, Toledo, Spain, 14-17 June

Abstracts/Posters

B. Mendes, M. Antunes, A. Usié, C. Leão, A.M. Ramos (2020). “Characterization of the stone pine (Pinus pinea) needle transcriptome: de novo assembly and SNP identification”. Bioinformatics open days. February 19th-21st, 2020, Braga, Portugal.

M. Antunes, B. Mendes, H. Magalhães, A. Usié, T. Sampaio, F. Simões, H. Almeida, A.M. Ramos (2020). “Identification of genetic markers for traits of economic importance in cork oak using high throughput SNP genotyping”. Bioinformatics open days. February 19th-21st, 2020, Braga, Portugal

B. Mendes, T. Sampaio, M. Antunes, H. Magalhães, A. Usié, F. Simões, H. Almeida, A.M. Ramos (2020). “Kinship analysis and Pedigree Reconstruction of a Self-Regenerating Cork Oak Population”. Bioinformatics open days. February 19th-21st, 2020, Braga, Portugal

A. Usié, H. Magalhães, M, Antunes, C. Leão, D. Gaspar, B. Meireles, P. Barbosa, L. Cachucho, A. Albuquerque, R. Charneca, J. Martins, E. Jerónimo, A.M. Ramos (2020). “Whole genome resequencing analysis of Alentejano pigs reveals differences associated with meat quality phenotypes”. Bioinformatics open days. February 19th-21st, 2020, Braga, Portugal

A. Usié, H. Magalhães, C. Leão, D. Gaspar, B. Meireles, P. Barbosa, L. Cachucho, A. Albuquerque, R. Charneca, J. Martins, E. Jerónimo, A.M. Ramos (2020). “Whole Genome Analysis of Alentejano Pigs with Contrasting Meat Quality Phenotypes”. Plant & Animal Genome XXVIII Conference, January 11-15, 2020 in San Diego, CA at the Town & Country Hotel and Convention Center.

C. Leão, A. Usié, M. Antunes, H. Magalhães and A.M. Ramos. (2018). “Identification and characterization of SNPs in stone pine (Pinus pinea) transcriptome”. Bioinformatics open days. March 14th-16th, 2018, Braga, Portugal.

Gaspar, D., Meireles, B., Usié, A., Barbosa, P., Scotti, P., Semedo, J., Pais, I., Maçãs, B., Almeida, A., Costa, R., Coutinho, J., Pinheiro, N., Matos, J., Simões, F., Mendonça, D., Guimarães, J., Ramos, A.M. (2017). Comparative analysis of transcriptional response to heat stress in two durum wheat (Triticum durum) varieties. 6th Bioinformatics Open Days, Braga, Portugal, 22-24 February

Meireles, B., Gaspar, D., Usié, A., Barbosa, P., Scotti, P., Semedo, J., Pais, I., Maçãs, B., Almeida, A., Costa, R., Coutinho, J., Pinheiro, N., Matos, J., Simões, F., Mendonça, D., Guimarães, J., Ramos, A.M. (2017). Identification of miRNAs related with the response to heat stress in two Triticum durum varieties. 6th Bioinformatics Open Days, Braga, Portugal, 22-24 February

Barros, P.M., Barbosa, P., Usié, A., Oliveira, M.M., Pesquita, C., Ramos, A.M. (2017). Alternative splicing detection across different tissues in cork oak. 6th Bioinformatics Open Days, Braga, Portugal, 22-24 February

Barbosa, P., Leão, C., Usié, A., Chaves, I., Amaro, A., Botelho, A., Pinto, C., Stevenson, K., Inácio, J., Ramos, A.M. (2016). Genome wide comparison between Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis non-pigmented and pigmented isolates. 5th Bioinformatics Open Days, Braga, Portugal, 18-19 February

Gaspar, D., Trindade, C., Usié, A., Barbosa, P., Fortes, A., Pesquita, C., Costa, R., Ramos, A.M. (2016). Characterization of the maritime pine (Pinus pinaster) transcriptome in the response to infection with Bursaphelenchus xylophilus, the causal agent of pine wilt disease. 5th Bioinformatics Open Days, Braga, Portugal, 18-19 February

Usié, A., Simões, F., Barbosa, P., Meireles, B., Chaves, I., Almeida, M.H., Matos, J., Ramos, A.M. (2016). Comprehensive analysis of the cork oak (Quercus suber) transcriptome involved in the regulation of bud sprouting and foliar development. 5th Bioinformatics Open Days, Braga, Portugal, 18-19 February

As linhas de investigação do Grupo de Engenharia de Processos centram-se em processos que possam impulsionar o desenvolvimento económico do Alentejo, através de utilização de produtos e materiais regionais em duas grande linhas de ação: a valorização de biomassa na perspectiva da biorrefinaria e a utilização de tecnologias de membranas de nanofiltração, procurando sempre que possível desenvolver processos que sejam mais amigos do ambiente. Ainda dentro do aspeto ambiental inicia os passos  para desenvolver trabalhos do comportamento de pesticidas em solo/água .

I. Conversão de biomassa lenhocelulósica em bioetanol ou outros compostos de valor acrescentado, no conceito de biorrefinaria

Neste âmbito estamos a desenvolver estudos de desconstrução de biomassa lenho-celulósica com metodologias inovadoras aplicada a várias biomassas; seleção de estirpes de Escherichia coli tolerantes a multi-inibidores resultantes dos pré-tratamentos da biomassa lenhocelulósica e ainda estudos de ensaios sacarificação e fermentação para produção de bioetanol e ácido láctico  a partir de resíduos de esteva destilada.

II –Membranas de nanofiltração

O Grupo de Engenharia de Processos desenvolve trabalho na área dos processos de separação com membranas de nanofiltração, aplicados à recuperação e separação seletiva de compostos bioativos e/ou de valor acrescentado, presentes em resíduos e sub-produtos agroindustriais. Também desenvolve trabalhos na área da aplicação da tecnologia de membranas para a recuperação/tratamento de águas de abastecimento/residuais.

III – Estudos com pesticidas

Desenvolvimento de trabalho que se enquadram no estudo do comportamento de pesticidas em solo focalizada no seguintes aspetos: adsorção/desorção, lixiviação e degradação.

Projetos Mestrado 

Para consultar os projetos de mestrado disponivels clique aqui.

Membros do grupo

Conceição Fernandes (CV) Investigadora Principal                            Doutorada em Química                             Universidade de Sevilha                                                  maria.fernandes@cebal.pt Tel. +351 284314399 Ext. 01023

Patricia Moniz (CV) Bolseira Pos-Doc Doutoramento em Engenheria Alimentar                           Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa   patricia.moniz@cebal.pt   Tel. +351 284314399 Ext. 01023

Talita Fernandes (CV) Bolseira Mestre Doutoramento em Engenheria Ambiental                        Instituto Superior de Agronomia, Universidade de Lisboa   talita.fernandes@cebal.pt   Tel. +351 284314399 Ext. 01023

Júnia Caturra (CV) Estudante de Doutoramento Mestre em Engenharia Ambiente                                Instituto Politécnico de Beja   junia.caturra@cebal.pt Tel. +351 284314399 Ext. 01024

Teresa Brás (CV) Estudante de Doutoramento   Mestre em Engenharia Química e Bioquímica                 FCT/UNL   teresa.bras@cebal.pt    Tel. +351 284314399 Ext. 01023

Ivone Torrado (CV) Estudante de Doutoramento Mestre em Engenharia Biológica                                 Universidade do Algarve   ivone.torrado@cebal.pt   Tel. +351 284314399 Ext. 01023

Ex-Membros do Grupo

Luisa Neves

Cristel Santos

 Projetos em curso 

-“SelecTEcoli – Seleção e caraterização de estirpes de E. coli com tolerância acrescida a multi-inibidores derivados dos processos de pré-tratamento da biomassa lenhocelulósica” ( ALENTEJO2020- REFª ALT20-03-0145-FEDER-000034)

 Projetos concluídos

- Projecto QREN - WaterTre&Val (ALENT-07-0224-FEDER-001756) – “Membrane technology for sustainable water treatment, recovery and valorisation”

- Projecto PRODER – “Desenvolvimento da fileira da romã – Da planta ao bago pronto a comer”

- Projeto Transferência de Tecnologia e Conhecimento em empresas do setor hortofrutícola e das carnes (CBL_13/02_PS_ADRAL)- “Estudo do potencial dos resíduos resultantes da produção da polpa de figo da índia e da produção do óleo das sementes de figo da índia”

- Projeto Vale Inovação “Biomassa Endógena - Produção de produtos transaccionáveis e energia a partir de recursos endógenos de biomassa vegetal subaproveitada”

Publicações recentes

Alves-Ferreira J;  Duarte LC, Fernandes MC, Pereira H, Carvalheiro F (in press).Hydrothermal treatments of Cistus ladanifer industrial residues obtained from essential oil distilleries. Waste and Biomass Valorization,. DOI 10.1007/s12649-017-0127-3

Fernandes MC,  Ferro MD,  Paulino  ANFC, Chaves HT, Evtuguin DV, Xavier AMRB (2018). Comparative study on hydrolysis and bioethanol production from cardoon and rockrose pretreated by dilute acid hydrolysis. Industrial Crops and Products 111: 633-641. DOI 10.1016/j.indcrop.2017.11.037

Fernandes M. C., Torrado I., Carvalheiro F., Dores V., Guerra V., Lourenço P. M. L., Duarte L. C (2016). Bioethanol production from extracted olive pomace: dilute acid hydrolysis. Bioethanol, 2: 103-111. DOI: 10.1515/bioeth.2016.007

Palma P., Fialho S., Alvarenga P., Santos C., Brás T., Palma, G. Cavaco C., Gomes R., Neves L.A. (2016). “Membranes technology used in water treatment: Chemical, microbiological and ecotoxicological analysis. Science of the Total Environment; 568: 998-1009. DOI:10.1016/j.scitotenv.2016.04.208

Brás T, Guerreiro O, Duarte M F, Neves L A (2015), "Impact of extraction parameters and concentration by nanofiltration on the recovery of phenolic compounds from Cynara cardunculus var. altilis: assessment of antioxidant activity", Industrial Crops and Products, 67: 137–142;

Fernandes MC, Ferro MD, Paulino AFC, Mendes JAS, Gravitis J, Evtuguin DV, Xavier AMRB (2015). Enzymatic saccharification and bioethanol production from Cynara cardunculus pretreated by steam explosion. Bioresource Technology; 189: 309-315.

Ferro MD, Fernandes MC, Paulino AFC, Prozil SO, Gravitis J, Evtuguin DV, Xavier AMRB (2015). Bioethanol production from steam explosion pretreated and alkali extracted Cistus ladanifer (rockrose). BEJ; 104:98-105.

Brás T, Guerra V, Torrado I, Carvalheiro F, Duarte LC, Neves LA (2014). Detoxification of hemicellulosic hydrolysates from extracted olive pomace dilute acid hydrolysate by diananofiltration. Process Biochemistry 49(1)173-180. DOI:10.1016/j.procbio.2013.09.017 ;

Brás T, Fernandes M C, Santos J L C, Neves L A(2013). Recovering bioethanol from olive bagasse fermentation by nanofiltration, Desalination and Water Treatment, 55: 4333-4342. DOI: 10.1080/19443994.2013.770216  

Capítulos de livros

Martinez, A., Rodríguez-Alegría, M.E., Fernandes, M.C., Gosset, G., Vargas-Tah, A., 2017. Metabolic Engineering of Escherichia coli for Lactic Acid Production from Renewable Resources, in: Gosset, G. (Ed.), Engineering of Microorganisms for the Production of Chemicals and Biofuels from Renewable Resources. Springer International Publishing, Cham, pp. 125–145. Doi:10.1007/978-3-319-51729-2_5

O Grupo de Engenharia de Processos desenvolve o seu trabalho de investigação na área dos Processos de Separação com Membranas, aplicados à recuperação e separação selectiva de compostos bioactivos e/ou de valor acrescentado, presentes em resíduos e sub-produtos agro-industriais.

As áreas de interesse do Grupo de Engenharia de Processos são:

1) desenvolvimento de processos de produção de extractos naturais ricos em compostos bioactivos  aplicados a diferentes tipos de resíduos ou sub-produtos agro-industriais (e.g., esteva, cardo, romã);

2) separação e recuperação de compostos de elevado valor acrescentado presentes em meios fermentativos;

3) produção de bioetanol a partir de resíduos agro-industriais e de biomassa lenhocelulósica (e.g., cardo e esteva).

Recentemente, o grupo de Engenharia de Processos tem desenvolvido trabalho na área de Tratamento de Efluentes e Recuperação de Água por Tecnologia de Membranas.

Membros do grupo

Luísa Neves Investigadora Convidada Doutorada em Engenharia Química Faculdade de Ciências e Tecnologia                             Universidade Nova de Lisboa   luisa.neves@cebal.pt Tel. +351 284314399 Ext. 01023

Conceição Fernandes Investigadora de Pós-Doutoramento                            Doutorada em Química                             Universidade de Sevilha   maria.fernandes@cebal.pt Tel. +351 284314399 Ext. 01023

Teresa Brás Bolseira de Investigação Cientifica   Mestre em Engenharia Química e Bioquímica                 FCT/UNL   teresa.bras@cebal.pt    Tel. +351 284314399 Ext. 01023

Cristele Santos Bolseira de Investigação Cientifica   Mestre em Engenharia do Ambiente                              FCT/UALG   cristele.santos@cebal.pt   Tel. +351 284314399 Ext. 01023

Miguel Ferro Bolseiro de investigação Mestrado Europeu em Quality in Analytical Laboratories Universitat de Barcelona, Universidade do Algarve Central South University   miguel.ferro@cebal.pt Tel. +351 284314399 Ext. 01023

Ana Paulino                                                              Estagiária do IEFP Mestre em Engenharia do Ambiente  Instituto Politécnico de Beja   ana.paulino@cebal.pt Tel. +351 284314399 Ext. 01023

Tânia Mesquita                                                         Estudante de Mestrado Licenciada em Biologia  Instituto Politécnico de Beja                         tania.mesquita@cebal.pt Tel. +351 284314399 Ext. 01024

Matthew Gonçalves Estudante de Mestrado                                              Licenciado em Energias Renováveis  Universidade dos Açores   matthewgoncalves@ua.pt Tel. +351 284314399 Ext. 01024

Júnia Caturra Estudante de Doutoramento Mestre em Engenharia Ambiente                                Instituto Politécnico de Beja   junia.caturra@cebal.pt Tel. +351 284314399 Ext. 01024

Sofia Fialho Estagiária do IEFP Licenciada em Engenharia Ambiente                              Instituto Politécnico de Beja       sofia.fialho@cebal.pt   Telf. +351 284 314 399   Ext. 01024

Projetos em curso

- Projecto QREN - WaterTre&Val (ALENT-07-0224-FEDER-001756) – “Membrane technology for sustainable water treatment, recovery and valorisation”

- Projecto PRODER – “Desenvolvimento da fileira da romã – Da planta ao bago pronto a comer”

- Projeto Transferência de Tecnologia e Conhecimento em empresas do setor hortofrutícola e das carnes (CBL_13/02_PS_ADRAL)- “Estudo do potencial dos resíduos resultantes da produção da polpa de figo da índia e da produção do óleo das sementes de figo da índia”

- Projeto Vale Inovação “Biomassa Endógena - Produção de produtos transaccionáveis e energia a partir de recursos endógenos de biomassa vegetal subaproveitada”

Publicações recentes

Teresa Brás, Vera Guerra, Ivone Torrado, Florbela Carvalheiro, Luís C. Duarte, Luísa A. Neves, "Detoxification of hemicellulosic hydrolysates from extracted olive pomace by diananofiltration", Process Biochemistry, Article in press, DOI:10.1016/j.procbio.2013.09.017 ;

Teresa Brás, Maria C. Fernandes, José Luís C. Santos, Luísa A. Neves, "Investigation of the recovery by nanofiltration of bioethanol resulting from olive bagasse fermentation", Desalination & Water Treatment, 51 (2013) 4333;

O Grupo de Valorização de Agro-Alimentos está focado na otimização dos sistemas de produção animal em condições Mediterrânicas, com particular interesse no estudo e desenvolvimento de estratégias nutricionais para melhorar a eficiência alimentar, a qualidade dos produtos e a sustentabilidade ambiental. Os trabalhos desenvolvidos centram-se principalmente nas seguintes áreas de investigação:

1. Uso de recursos alimentares alternativos, como subprodutos agroindustriais e plantas endógenas na dieta de ruminantes;

2. Metabolismo lipídico ruminal e estratégias alimentares para melhorar a composição em ácidos gordos na gordura dos ruminantes;

3. Abordagens nutricionais para melhorar o estado antioxidante dos animais e prevenir a oxidação lipídica nos produtos.

Membros do Grupo

Eliana Jerónimo (CV, Ciência ID, Orcid ID, Reserarchgate profile)   Investigadora Principal                Doutorada em Ciências Agrárias                     Universidade de Évora     eliana.jeronimo@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01026

Olinda Guerreiro (CV)   Investigadora de Pós-Doutoramento                    Doutorada em Ciências Veterinárias,                                         especialidade Produção Animal   Instituto Politécnico de Beja     olinda.guerreiro@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023/01024

David Soldado (CV)   Estudante de Doutoramento                                                   Mestre em Bioquímica   FCT/UNL     david.soldado@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023/01024

Liliana Cachucho (CV)   Estudante de Doutoramento   Mestre em Engenharia Zootecnica                                          Universidade de Évora     liliana.cachuco@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023/01024

Letícia Fialho (CV)   Estudante de doutoramento                                                  Mestre em Biotecnologia                      FCT/UNL      leticia.fialho@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023/01024

Silvana Luz (CV)   Estudante de Doutoramento                     Mestrado em Engenharia do Ambiente                                  Instituto Politécnico de Beja     silvana.luz@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023/01024

Ex-membros do Grupo

Rute Martins, Bolseira de Investigação, 2019 – 2020

Valentina Pinheiro, Bolseira de Investigação, 2019

Ricardo Santos, Bolseiro de Investigação, 2017 – 2019

Luís Madeira, Bolseiro de Investigação, 2017 – 2018

Ana Rita Prazeres, Investigadora de Pós-Doutoramento – 2014 – 2020

Susana Sengo, Estágio Profissional, 2013 – 2014

Daniela Rodrigues, Bolseira de Investigação, 2013

Flávia Fernandes, Bolseira de Investigação, 2012 – 2017

Laura Felício, Bolseira de Investigação, 2011 – 2012

Projetos em Curso

2020 – Val+Alentejo – “Valorização dos produtos dos pequenos ruminantes do Alentejo” (ALENTEJO2020 – Refª ALT20-03-0246-FEDER-000049)

2018 – Grupo Operacional – LegForBov- Alimentos alternativos na produção de carne de bovino (Refª PDR2020-1.0.1-FEADER-031184)

2018 – Grupo Operacional – SubProMais - Utilização de Subprodutos da Agroindústria na Alimentação Animal (Refª PDR2020-1.0.1-FEADER-030993)

2017 - Grupo Operacional – LACTIES - Inovação, Eco-Eficiência e Segurança em PME’s do Setor dos Lacticínio. (Refª PDR2020-1.0.1-FEADER-030780)

2016 - SelectPorAl: “Seleção e melhoramento genómico de características produtivas do Porco Alentejano” (ALENTEJO2020 - Refª ALT20-03-0145-FEDER-000032)

Projetos Concluídos

2017 - 2020: Inov@sfileiras (REFª PDR2020-2024-032732)

2017 – 2020: INNOACE – Innovación abierta e inteligente en la EUROACE. Actividad 2 - Ación 2. Tarea 7. Propuestas para una gestión eficiente de la fertilización en plantaciones frutales de regadío en la zona Alentejo-Extremadura” (POCTEP).

2016 – 2020: HydroReuse - “Tratamento e reutilização de águas residuais agroindustriais utilizando um sistema hidropónico inovador com plantas de tomate” (ALENTEJO2020 - Refª ALT20-03-0145-FEDER-000021)

2016 – 2020: CistusRumen - “Utilização sustentável da Esteva (Cistus ladanifer L) em pequenos ruminantes - Aumento da competitividade e redução do impacto ambiental” (ALENTEJO2020 -Refª ALT20-03-0145-FEDER-000023)

2016 – 2019: ValRuMeat - “Valorização da carne de ruminantes em sistemas intensivos de produção” (ALENTEJO2020 - Refª ALT20-03-0145-FEDER-000040)

2014 - 2015: "UnValHortFrut - Unidade de Valorização de Produtos Hortofrutícolas” (INALENTEJO)

2012 - 2015: “Desenvolvimento da fileira da romã – Da planta ao bago pronto comer” (PRODER)

2011 - 2013: “RITECA II - Rede de Investigação Transfronteiriça da Extremadura, Centro e Alentejo (Fase II)” (POCTEP)

Publicações recentes

Artigos em revistas de circulação internacional com revisão por pares

Jerónimo, E., Soldado, D., Sengo, S., Francisco, A., Fernandes, F., Portugal, A. P. V., Alves, S. P., Santos-Silva, J., Bessa, R. J. B., 2020. Increasing the α-tocopherol content and lipid oxidative stability of meat through dietary Cistus ladanifer L. in lamb fed increasing levels of polyunsaturated fatty acid rich vegetable oils. Meat Science, 164, 108092. https://doi.org/10.1016/j.meatsci.2020.108092

Guerreiro, R., Jerónimo, E., Luz, S., Pinheiro, H., Prazeres, A. R., 2020. Cheese manufacturing wastewater treatment by combined physicochemical processes for reuse and fertilizer production. Journal of Environmental Management. 264, 110470. https://doi.org/10.1016/j.jenvman.2020.110470

Jerónimo, E., Cachucho, L., Soldado, D., Guerreiro, O., Bessa, R. J. B., Alves, S. P., 2020. Fatty acid content and composition of the morphological fractions of Cistus ladanifer L. and its seasonal variation. Molecules, 25 (7), 1550. https://doi.org/10.3390/molecules25071550

Dentinho, T., Paulos, K., Francisco, A., Jerónimo, E., Almeida, J. M., Bessa, R. J. B., Santos-Silva, J., 2020. Effect of soybean meal treatment with Cistus ladanifer condensed tannins in growth performance, carcass and meat quality of lambs. Livestock Science, 236, 104021. https://doi.org/10.1016/j.livsci.2020.104021

Ribeiro, D. M., Planchon, S., Leclercq, C. C., Dentinho, M. T., Bessa, R. J. B., Santos-Silva, J., Paulos, K., Jerónimo, E., Renaut, J., Almeida, A. M., 2020. The effects of improving low dietary protein utilization on the proteome of lamb tissues. Journal of Proteomics, 103798. https://doi.org/10.1016/j.jprot.2020.103798

Prazeres, A. R., Fernandes, F., Luz, Silvana, Jerónimo., E., 2020. Simple processes for the total phosphorus removal in cheesemaking wastewater: CaCO3, Mg(OH)2, FeSO4 and FeCl3. Journal of Environmental Chemical Engineering, 8 (4), 104034, https://doi.org/10.1016/j.jece.2020.104034

Santos-Silva, J., Alves, S. P., Francisco, A., Portugal, A. P., Almeida, J. M., Fialho, L., Jerónimo, E., Bessa, R. J. B., 2020. Effects of a high-fiber and low-starch diet in growth performance, carcass and meat quality of young Alentejana breed bulls. Meat Science, 168, 108191. https://doi.org/10.1016/j.meatsci.2020.108191

Prazeres, A. R., Afonso, A., Guerreiro, R., Jerónimo., E., 2020. Contamination reduction of real olive oil mill wastewater using innovative acid and basic chemical precipitation processes. International Journal of Environmental Science and Technology. https://doi.org/10.1007/s13762-020-02924-5

Guerreiro, O., Alves, S. P., Soldado, D., Cachucho, L., Almeida, J. M., Francisco, A., Santos-Silva, J., Bessa, R. J. B., Jerónimo, E., 2020.  Inclusion of the aerial part and condensed tannin extract from Cistus ladanifer L. in lamb diets – Effects on growth performance, carcass and meat quality and fatty acid composition of intramuscular and subcutaneous fat. Meat Science, 160:107945. https://doi.org/10.1016/j.meatsci.2019.107945

Francisco, A., Janíček, M., Dentinho, M. T., Portugal, A. P., Almeida, J., Alves, S. P., Fialho, L., Jerónimo, E., Santos-Silva, J., Bessa, R. J. B., 2020. Effects of alfalfa particle size and starch content in diets on feeding behaviour, intake, rumen parameters, animal performance and meat quality of growing lambs. Meat Science, 161: 107964. https://doi.org/10.1016/j.meatsci.2019.107964

Santos-Silva, J., Francisco, A., Alves, S. P., Portugal, P., Dentinho, T., Almeida, J., Soldado, D., Jerónimo, E., Bessa, R. J. B., 2019. Effect of dietary neutral detergent fibre source on lambs growth, meat quality and biohydrogenation intermediates. Meat Science, 147: 28-36. https://doi.org/10.1016/j.meatsci.2018.08.015

Lamy, E., Rodrigues, L., Guerreiro, O., Soldado, D., Francisco, A., Lima, M., Capela e Silva, F., Lopes, O., Santos-Silva, J., Jerónimo, E., 2019. Changes in salivary protein composition of lambs supplemented with aerial part and condensed tannins extract from Cistus ladanifer L.: A preliminary study. Agroforesty Systems, 94: 1501–1509.  https://doi.org/10.1007/s10457-019-00386-4

Prazeres, A. R., Fernandes, F., Madeira, L., Luz, S., Albuquerque, A., Simões, R., Beltrán, F., Jerónimo, E., Rivas, J., 2019. Treatment of slaughterhouse wastewater by acid precipitation (H2SO4, HCl and HNO3) and oxidation (Ca(ClO)₂, H2O2 and CaO₂). Journal of Environmental Management, 250: 109558. https://doi.org/10.1016/j.jenvman.2019.109558

Prazeres, A. R., Lelis, J., Alves-Ferreira, J., Carvalho, F., 2019. Treatment of vinasse from sugarcane ethanol industry: H2SO4, NaOH and Ca(OH)2 precipitations, FeCl3 coagulation-flocculation and atmospheric CO2 carbonation. Journal of Environmental Chemical Engineering, 7 (4), Article 103203. https://doi.org/10.1016/j.jece.2019.103203

Prazeres, A. R., Fernandes, F., Luz, S., Jerónimo, E., 2019. Cheese wastewater treatment by acid and basic precipitation: application of H2SO4, HNO3, HCl, Ca(OH)2 and NaOH. Journal of Environmental Chemical Engineering. 103556. https://doi.org/10.1016/j.jece.2019.103556

Vieira, F. N., Lourenço, S. M. C., Fidalgo, L., Santos, S. A. O., Silvestre, A. J. D., Jerónimo, E., Saraiva, J. A., 2018. Long-term effect on bioactive components and antioxidant activity of thermally and high pressure pasteurized orange juice. Molecules - The Antioxidant Capacities of Natural Products 23(10) 2706: 1-15.  https://doi.org/10.3390/molecules23102706

Francisco, A., Alves, S. P., Portugal, P. V., Dentinho, M. T., Jerónimo, E., Sengo, S., Almeida, J. M., Bressan, M. C., Pires, V., Alfaia, C., Prates, J. M. P., Bessa, R. J. B., Santos-Silva, J., 2017. Effects of dietary inclusion of citrus pulp and rockrose soft stems and leaves on lamb meat quality and fatty acid composition. Animal 12(4):872-881. https://doi.org/10.1017/S1751731117002269

Ramos, P. A. B., Guerra, A. R., Guerreiro, O., Santos, S. A. O., Oliveira, H., Freire, C. S. R., Silvestre, A. J. D., Duarte, M. F., 2017. Antiproliferative effects of Cynara cardunculus L. var. altilis (DC) lipophilic extracts. International Journal of Molecular Sciences, 18(1), 63. https://doi.org/10.3390/ijms18010063

Ferro, A., Ramos, P., Guerra, A., Parreira, P., Bras, T., Guerreiro, G., Jerónimo, E., Duarte, F., Lozano, R., Oliveira, M., Gonçalves, S., 2017. Haplotype analysis of the germacrene A synthase gene and association with cynaropicrin content and biological activities in Cynara cardunculus. Molecular Genetics and Genomics. https://doi.org/10.1007/s00438-017-1388-z

Francisco, A., Alves, S., Portugal, P. V., Dentinho, M. T., Jerónimo, E., Sengo, S., Almeida, J. M., Bressan, M. C., Pires, V., Alfaia, C., Prates, J. M. P., Bessa, R. J. B., Santos-Silva, J., 2017. Effects of dietary inclusion of citrus pulp and rockrose soft stems and leaves on lamb meat quality and fatty acid composition. Animal. https://doi.org/10.1017/S1751731117002269

Van Leeuwen, K.A., Camin, F, Jerónimo, E., Vasta, V., Prenzler, P. D., Ryan, D., Bessa, R.  J.  B. (2017). Dietary effects on stable carbon isotope composition of fatty acids in polar and neutral fraction of intramuscular fat of lambs. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 65 (43): 9404–9411. http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jafc.7b02999

Ferro, A., Ramos, P., Guerreiro, G., Jerónimo, E., Pires, I., Capel, C., Capel, J., Lozano, R., Duarte, F., Oliveira, M., Gonçalves, S., 2017. Impact of novel SNPs identified in Cynara cardunculus genes on functionality of proteins regulating phenylpropanoid pathway and their association with biological activities. BMC Genomics, 18:183. https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-3534-8

Almeida, A., Carvalho, F., Imaginario, M. J., Castanheira, I., Prazeres, A. R., Ribeiro., C., 2017. Nitrate removal in vertical flow constructed wetland planted with Vetiveria zizanioides: Effect of hydraulic load. Ecological Engineering, 99: 535-542. https://doi.org/10.1016/j.ecoleng.2016.11.069

Guerreiro, O., Alves, S. P., Costa, M., Cabo, A., Duarte M. F., Jerónimo E., Bessa R. J. B., 2016. Effects of extracts obtained from Cistus ladanifer L. on in vitro rumen biohydrogenation. Animal Feed Science and Technology, 129: 304-312. http://dx.doi.org/10.1016/j.anifeedsci.2016.06.024

Guerreiro, O., Guerra, A. R., Ramos, P. A. B., Moreira, O. C., Dentinho, M. T. P., Bessa, R. J. B., Duarte, M. F., Jerónimo, E., 2016. Potential of Cistus ladanifer L. shrub for ruminant diets – Effect of season and plant age on chemical composition, in vitro digestibility and antioxidant activity. Grass and Forage Science, 71: 437-447. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/gfs.12188/abstract

Francisco, A., Alves, S. P., Pires, V. M. R., Dentinho, M. T., Alfaia, C. M., Jerónimo, E., Prates, J. A. M., Santos-Silva, J., Bessa, R. J. B., 2016. Effect of feeding lambs with a tanniferous shrub (rockrose) and a vegetable oil blend on fatty acid composition of meat lipids. Animal, 10:12, 2061–2073 https://doi.org/10.1017/S1751731116001129

Prazeres, A. R., Rivas, J., Almeida, M. A., Patanita, M., Dôres, J., Carvalho, F., 2016. Agricultural reuse of cheese whey wastewater treated by NaOH precipitation for tomato production under several saline conditions and sludge management. Agricultural Water Management, 167: 62–74. http://dx.doi.org/10.1016/j.agwat.2015.12.025

Prazeres, A. R., Rivas, J., Paulo, U., Ruas, F., Carvalho, F., 2016. Sustainable treatment of different high-strength cheese whey wastewaters: an innovative approach for atmospheric CO2 mitigation and fertilizer production. Environmental Science and Pollution Research, 23 (13): 13062-13075. http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11356-016-6429-3

Francisco, A., Dentinho, M. T., Alves, S. P., Portugal, P. V., Fernandes, F., Sengo, S., Jerónimo, E., Oliveira, M. A., Costa, P., Sequeira, A., Bessa, R. J. B., Santos-Silva, J., 2015. Growth performance, carcass and meat quality of lambs supplemented with increasing levels of a tanniferous bush (Cistus ladanifer L.) and vegetable oils. Meat Science, 100: 275-282. http://dx.doi.org/10.1016/j.meatsci.2014.10.014

Guerreiro, O., Alves, S. P., Duarte, M. F., Bessa, R. J. B., Jerónimo, E., 2015. Cistus ladanifer L. shrub is rich in saturated and branched chain fatty acids and their concentration increase in Mediterranean dry season. Lipids, 50:493–501. http://link.springer.com/article/10.1007/s11745-015-4001-4

Capítulos de livro

Jerónimo, E., Dentinho, M. T., Guerreiro, O., Francisco, A., Soldado, D., Alves, S. P., Santos-Silva, J., Bessa, R. J. B. 2020. Cistus ladanifer L. in Ruminant Diets – A Sustainable Approach to Improve the Feed Nutritional Value and the Quality of Edible Products. In: Freitas Duarte A., Lopes da Costa L. (eds) Advances in Animal Health, Medicine and Production. Springer, Cham. (ISBN 978-3-030-61981-7) https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-030-61981-7_7

Prazeres, A. R., Albuquerque, A., Luz, S., Jerónimo, E., Carvalho, F., 2017. Hydroponic system: a promising biotechnology for food production and wastewater treatment (Chapter 11). Food Biosynthesis - Handbook of Food Bioengineering, Volume 1. Grumezescu, A. M., and Holban, A. M. (editors). Elsevier, Academic Press, pp 317-35 (ISBN 978-0-12-811372-1). https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/B9780128113721000117

Jerónimo, E., Pinheiro, C., Lamy, E., Dentinho, M. T., Sales-Baptista, E., Lopes, O., Capela e Silva, F., 2016. Tannins in ruminant nutrition - Impact on animal performance and quality of edible products (Chapter 5). Tannins: Biochemistry, Food Sources and Nutritional Properties. Combs, C. A. (editor). Nova Science Publishers, pp 121-168 (ISBN 978-1-63484-150-4). https://www.novapublishers.com/catalog/product_info.php?products_id=56550

Jerónimo, E., Malcata, F. X., 2016. Cheese – Composition and health effects (Chapter 137). Encyclopedia of Food and Health.  Caballero, B., Finglas, P., Toldrá, F. (editors). Oxford: Academic Press, pp 741-747 (ISBN 9780123849472). http://dx.doi.org/10.1016/B978-0-12-384947-2.00137-9

Jerónimo, E., Malcata, F. Xavier, 2013. Lipid fraction in cheese: nutritional value and strategies for improvement (Chapter 13). Handbook Cheese: Production, Chemistry and Sensory Properties. Castelli, H., Vale, Luiz (editors). Nova Science Publishers, Inc., pp. 439-457. (ISBN 978-1-62618-966-9). https://www.novapublishers.com/catalog/product_info.php?products_id=45549

Jerónimo, E., Malcata, F. Xavier, 2013. Sensory characteristics of cheese. Handbook of Cheese in Health: Production, Nutrition and Medical Sciences. Preedy, V. R., Watson, R. R., Patel,V. B. (editors). Wageningen Academic Publishers, pp. 39-52. (ISBN: 978-90-8686-211-5). http://www.wageningenacademic.com/doi/10.3920/978-90-8686-766-0_3

Jerónimo, E., Malcata, F. Xavier, 2011. Caseins in traditional Portuguese cheeses: from science to applications. Casein: Production, Uses and Health Effects. Ventimiglia, A.M. and Birkenhager, J.M. (editores), Nova Science Publishers, Inc., pp. 101-122. (ISBN 978-1-62100-129-4). https://www.novapublishers.com/catalog/product_info.php?products_id=22938

O grupo de Valorização de Agro-Alimentos, desenvolve o seu trabalho de investigação em matrizes alimentares de natureza tradicional e importância económica regional, quer de origem vegetal quer de origem animal, procedendo à sua caracterização e propondo melhorias de processo e produto.

De momento, o grupo está empenhado na elucidação das bases fisiológicas e bioquímicas das alterações de qualidade em frutos minimamente processados, com vista ao desenvolvimento de processos e tecnologias que garantam a sua qualidade ao longo de toda a cadeia de abastecimento. Com vista a valorização dos frutos produzidos na região, também existe uma forte aposta na sua caracterização em termos da sua composição fitoquímica e bioactividade.

No que se refere aos produtos de origem animal, o grupo centra os seus esforços na utilização de plantas endógenas ou subprodutos da agro-indústria em estratégias nutricionais que possam melhorar o valor nutricional e a estabilidade oxidativa destes produtos. Neste âmbito está a decorrer a caracterização química de algumas plantas e subprodutos abundantes na região, com vista à avaliação do potencial deste tipo de biomassa para aplicação nestas estratégias nutricionais.

Membros do Grupo

Eliana Jerónimo   Investigadora de Pós-Doutoramento                Doutorada em Ciências Agrárias   Universidade de Évora     eliana.jeronimo@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023

Flávia Fernandes   Bolseira de Investigação Científica   Mestre em Tecnologia e Segurança Alimentar   FCT/UNL     flavia.fernandes@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023

Daniela Rodrigues                                         Bolseira de Investigação   Mestrado Integrado em Engenharia Biológica   Universidade do Algarve     daniela.rodrigues@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023/01024

Olinda Guerreiro   Estudante de Doutoramento                           Mestrado em Engenharia Alimentar   Instituto Politécnico de Beja     olinda.guerreiro@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023/01024

Susana Sengo                                              Estágio Profissional   Mestrado em Bioquímica   Universidade de Évora     susana.sengo@cebal.pt    Tel. +351 284314399   Ext. 01023/01024

David Soldado   Estudante de Mestrado                                  Licenciatura em Biotecnologia   Universidade de Évora     david.soldado@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023/01024

Projetos Concluídos

2011 – “RITECA II - Rede de Investigação Transfronteiriça da Extremadura, Centro e Alentejo (Fase II)” (POCTEP)

Projetos em curso

2011 - “NEW PROTECTION: Efeitos de estirpes probióticas em azeitonas em calda” (PTDC/AGR-ALI/117658/2010).

2013 – “Desenvolvimento da fileira da romã – Da planta ao bago pronto comer” (PRODER)

2013 – A2 Transfer – Transferência de Novas Tecnologias na Indústria Agro-Alimentar Andaluzia – Alentejo

2014 - "UnValHortFrut - Unidade de Valorização de Produtos Hortofrutícolas” (INALENTEJO)

2014 – “MITIC – Modernización e innovación tecnológica con base TIC en sectores estratéicos y tradicionales” (POCTEP)

Publicações recentes

Jerónimo, E., Malcata, F. Xavier, 2013. Sensory characteristics of cheese. Handbook of Cheese in Health: Production, Nutrition and Medical Sciences. Preedy, V. R., Watson, R. R., Patel,V. B. (editors). Wageningen Academic Publishers. (ISBN: 978-90-8686-211-5).

Jerónimo, E., Malcata, F. Xavier, 2013. Lipid fraction in cheese: nutritional value and strategies for improvement (Chapter 13). Cheese: Production, Chemistry and Sensory Properties. Castelli, H., Vale, Luiz (editors). Nova Science Publishers, Inc., pp. 439-457. (ISBN 978-1-62618-966-9).

O grupo dos Compostos Bioativos tem a sua atividade de investigação centrada na caracterização de extratos naturais, ou compostos puros, e no subsequente estudo e otimização dos processos extrativos e da sua atividade biológica. O grupo comporta quatro principais linhas de investigação:

1. Desenvolvimento de processos extrativos e/ou purificação para obtenção de compostos/frações de interesse;
2. Obtenção e caraterização fitoquímica de extratáveis resultantes de diferentes tipos de biomassa, com vista à recuperação e isolamento de compostos de valor acrescentado;
3. Estudo do potencial biológico de diferentes matrizes naturais, com foco na resposta anti-tumoral e anti-microbiana
4. Avaliação do potencial biológico para desenvolvimento de novas soluções biofarmacêuticas e biotecnológicas

Com especial destaque para o estudo da atividade anti-tumoral e antimicrobiana (para estirpes multirresistentes), e com a exploração de diferentes matérias-primas, nomeadamente o cardo (Cynara cardunculus) e o azeite, bem como resíduos da indústria agroflorestal e agroalimentar (casca do eucalipto, bagaço de azeitona, e plantas aromáticas), o grupo dos compostos bioactivos tem como principal objetivo o conhecimento bioquímico de matrizes vegetais e a sua subsequente valorização em soluções de base tecnológica, nomeadamente no sector biofarmacêutico e agroalimentar.

Membros do Grupo

Fátima Duarte (CV; Researchgate profile, Orcid)      Investigadora Principal   Doutoramento em Ciências da Saúde    Universidade do Minho   Maine Medical Center Research Institute, USA           fatima.duarte@cebal.pt    Tel. + 351 284314399   Ext. 01023

Rita Martins (CV)   Bolseira de Investigaçao no projeto TeCMeM   (TeCnologia de Membranas em Movimento)   Doutoramento em Bioquímica   Universidade de Beira Interior      rita.martins@cebal.pt   Tlm: +351 962 978 272   Tel:+351 284 314 399   Ext. 01023

Ângela Guerra (CV)   Estudante de doutoramento                                 Mestre em Bioquímica   Universidade de Évora     angela.guerra@cebal.pt   Tel:+351 284 314 399   Ext. 01023

Teresa Brás (CV)   Estudante de Doutoramento                                  Mestrado em Engenharia Química e Bioquímica   FCT/UNL    teresa.bras@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023

Miguel Ferro (CV) Bolseiro de Investigação no projeto OleaValor Mestrado Europeu em Quality in Analytical Laboratories Universitat de Barcelona, Universidade do Algarve Central South University   miguel.ferro@cebal.pt Tel. +351 284314399 Ext. 01023

Ana Paulino (CV)   Estudante de Doutoramento   Mestrado em Engenharia do Ambiente                  IPB/ESA     ana.paulino@cebal.pt   Tel. + 351 284 314 399   Ext. 01023

Mónica Fernandes   Bolseira de Investigação no projeto ValBioTecCynara   Mestrado em Microbiologia                  Universidade de Aveiro      monica.fernandes@cebal.pt   Tel. + 351 284 314 399   Ext. 01107

Daniela Rosa (CV)   Bolseira de Investigação no projeto ValBioTecCynara   Mestrado em Bioquímica                  FCT/UNL      daniela.rosa@cebal.pt   Tel. + 351 284 314 399   Ext. 01107

Maria Castro (CV)   Bolseira de Investigação no projeto ValBioTecCynara   Mestrado em Bioquímica                  Universidade do Porto     maria.castro@cebal.pt   Tel. + 351 284 314 399   Ext. 01107

Ex-Membros do Grupo

Ana Ferro, Bolseira de Investigação, Setembro 2016-Março 2017

Paula Parreria, Pos-Doc, 2013-2016

Filomena Silva, Aluna de Doutoramento, 2011-2015

Patricia Ramos, Bolseira de investigação, 2014-2015

Nádia Morete, bolseira de investigação, 2015

Raquel Gonçalves, bolseira de investigação, 2013

Laura Felício, aluna de mestrado, 2012

Zélia Velez, Pos-Doc, 2009-2011

Laura Garcia, bolseira pelo programa Becas-Agro, 2011

Filipa Costa, aluna de mestrado, 2010

Tanit Arnedo, bolseira pelo programa Becas-Agro, 2009

Projetos em curso

2015- ValBioTecCynara - Valorização económica do cardo (Cynara cardunculus): variabilidade natural e suas aplicações biotecnológicas (ALT20-03-0145- FEDER-000038)

2016 – CistusRumen - Utilização sustentável da Esteva (Cistus ladanifer L) em pequenos ruminantes – Aumento da competitividade e redução do impacto ambiental (ALT20-03-0145-FEDER-000023)

2016 – TeCMeM - Tecnologia de Membranas em Movimento (ALT20-03-0246-FEDER-000003)

2016 – Estimular - Inovação e Competitividade nas Áreas Rurais (ALT20-01-0853-FEDER-000010)

2016 – OLEAVALOR - Valorização das Variedades de Oliveira Portuguesas (ALT20-03-0145-FEDER-000014)

Projetos concluídos

1. “RefinOlea: Valorização integrada de resíduos e subprodutos da extracção de azeite" FCOMP-01-0202-FEDER-005450, ADI em Co-Promoção, as part of the research team. FD as Coordinator from CEBAL ativities (June 2009-January 2013)
2. “Removal of cytotoxic chemotherapy compounds from pharmaceutical/hospital wastewaters by combined membrane processing and advanced electro-oxidation treatment" PTDC/AAC-AMB/100960/2008. CEBAL as participating institution, and FD as part of the research team. (January 2010-January 2013)
3. “BIECOS: Valorização Integrada de Biomassa" ALENT-09-0140-FEDER-000705 INALENTEJO. FD as responsible investigator (Octocber 2010-2014)
4. “RitecaII - Research network Portugal-Spain - including Extremadura, Centro e Alentejo (Phase II)” POCTEP. CEBAL as participating institution, FD as part of the research team (2011-2012)
5. “NEW PROTECTION: NativE, Wild PRObiotics sTrain EffeCT in Olives in briNe" PTDC/AGR-ALI/117658/2010. CEBAL as participating institution, FD as part of the research team (November 2011- October 2013)
6. “UnValBio - Unidade de Valorização de Resíduos e Matérias-Primas de Origem Biológica” ALENT-07-0262-FEDER-001860 INALENTEJO. FD as coordinator from CEBAL (2012-June 2015)
7. “NEucBark – new valorization strategies for Eucalyptus spp. bark extracts" PTDC/AGR-FOR/3187/2012. FD as responsible investigator (June 2013-September 2015)
8. “MITIC - Modernización e innovación tecnológica con base TIC en sectores estratégicos y tradicionales” POCTEP. CEBAL as participating institution. FD as coordinator of CEBAL research tasks (June 2013-October 2015)
9. "UnValHortFrut - Unidade de Valorização de Produtos Hortofrutícolas” INALENTEJO, FDas part of the research team (October 2013-June 2015)
10. “Desenvolvimento da fileira da romã – da planta ao bago pronto a comer” ProDeR medida 3.1 45071, FD as part of the research team (June 2013-May 2015)

Capítulos de Livro

Silva, F.S., Soares, B., Calçada, C., Guerra, A.R., Pereira-Wilson, C., Lima, C.F., Freire, C.S.R., Silvestre, A.J.D., Duarte, M.F. New valorization strategies for Eucalyptus spp. bark extracts.Wastes: Solutions, Treatments and Opportunities. Vilarinho, Castro & Russo (eds) 2015 Taylor & Francis Group, London, ISBN: 978-1-138-02882-1 (Hardback).

Parreira, P., Brás, T., Ramos, P.A., Duarte, M.F. Bioactives against Superbugs: using phytotherapy to counteract the drug-resistance burden in the 21st century. The Battle Against Microbial Pathogens: Basic Science, Technological Advances and Educational Programs. pages 109-116. Editor: A. Méndez-Vilas; Publisher: Formatex Research Center ISBN (13): 978-84-942134-6-5, December 2015

Publicações recentes

Mota, I., Pinto, P.C.R, Novo, C., Sousa, G., Guerreiro, O., Guerra, A., Duarte, M.F., and Rodrigues, A. E. Extraction of polyphenolic compounds from Eucalyptus globulus bark: process optimization and screening for biological activity. Industrial & Engineering Chemistry Research 2012 May; 51(20):6991-7000.

Tiburcio, M., Costa, M.A.S., Duarte, M., Schmitt F.C., Longatto Fillho, A. Characterization of PAR1 and FGFR1 Expression in Invasive Breast Carcinomas: Prognostic Significance. Oncology Letters 2012; (4):647-657.

Kirov, A., Duarte, M., Guay, J., Karolak, M., Yan, C., Oxburgh, L., and Prudovsky, I. Transgenic expression of nonclassically secreted FGF suppresses kidney repair. PLoS One. 2012;7(5):e36485. Epub 2012 May 14.

Velez, Z., Campinho, M.A., Guerra, A., Garcia, L., Ramos, P., Guerreiro, O., Felicio, L., Schmitt, F., Duarte, M. Biological Characterization of Cynara cardunculus L. Methanolic Extracts: Antioxidant, Anti-proliferative, Anti-migratory and Anti-angiogenic Activities. Agriculture 2012; 2(4): 472-492.

Guerreiro, O., Velez, Z., Alvarenga, N., Matos, C., and Duarte, M. Molecular screening of ovine mastitis in different breeds. J Dairy Science. 2013; 96(2): 752-760.

Mota, I., Pinto, P.C.R, Novo, C., Sousa, G., Guerreiro, O., Guerra, A., Duarte, M.F., and Rodrigues, A. E. Eucalyptus globulus bark as source of polyphenolic compounds with biological activity. O Papel 2013 January; 74(1):57-64.

Ramos, P., Santos, S.A.O., Guerra, A.R., Guerreiro, O., Felicio, L., Jerónimo, E., Silvestre, A.J.D., Neto, C.P., Duarte M. Valorisation of olive mill residues antioxidant and breast cancer antiproliferative activities of hydroxytyrosol-rich extracts derived from olive oil by-products. Industrial Crops and Products 2013; (46) 359-368.

Gomes, F.P., Silva, N., Trovatti, E., Serafim L.S., Duarte, M., Silvestre,A.J.D., Freire C.S.R. Production of Bacterial Cellulose by Gluconacetobacter sacchari using dry olive mill residue. Bioenergy and Biomass. 2013; 55:205-211.

Mota, I., Pinto, P.C.R, Novo, C., Sousa, G., Guerreiro, O., Guerra, A., Duarte, M.F., and Rodrigues, A. E. Eucalyptus globulus bark as source of polyphenolic compounds with biological activity. O Papel. 2013, 74(1):57-64.

Ramos, A.B.P., Guerra, A.R., Guerreiro, O., Freire, C.S.R., Silva, A.M.S., Duarte, M.F., and Silvestre, A.J.D. Lipophilic extracts of Cynara cardunculus L. var. altilis (DC): A source of valuable bioactive terpenic compounds. Journal of Agricultural and Food Chemistry. 2013, 61(35):8420–8429.

Domingues, R.M.A., Guerra, A.R., Duarte, M., Freire, C.S.R., Neto, C.P., Silva, C.M.S., and Silvestre, A.J.D. Bioactive triterpenic acids: from agroforestry biomass residues, to promising therapeutic tools. Mini-Reviews in Organic Chemistry. 2014, 11:382-399.

Parreira, P., Duarte, M.F., Reis, C.A. and Martins, M.C.L. Helicobacter pylori infection: A brief overview on alternative natural treatments to conventional therapy. Critical Reviews in Microbiology. 2014, 7828:1–12.

Ramos, A.B.P., Santos, S.A.O. Guerra, A.R., Guerreiro, O., Freire, C.S.R., Silva, A.M.S., Duarte, M.F., and Silvestre, A.J.D. Phenolic composition and antioxidant activity of different morphological parts of Cynara cardunculus L. var. altilis (DC). Industrial Crops and Products. 2014, 61:460-471.

Guerra, A.R.; Soares, B; Guerreiro, O; Ramos, P; Oliveira, H; Silvestre, A; Freire, C; Duarte, MF. Anti-tumoral activity of lipophilic Eucalyptus bark extracts, enriched on triterpenic acids, against breast cancer cells. Planta Med 2014; 80 SL41. DOI: 10.1055/s-0034-1394529.

Guerra, A.R, Neyton, S., Duarte, M.F. Role of triterpenic acids on thrombin regulation and PAR1 signaling. Planta Med 2014; 80 P1L113. DOI: 10.1055/s-0034-1394770.

Ramos, P., Guerra, A.R., Guerreiro, O., Santos, S., Oliveira, H., Freire, C., Rocha, S., Silvestre, A.J.D., Duarte, M.F. Antitumoral and antioxidant activities of lipophilic and phenolic extracts from Cynara cardunculus L. var. altilis (DC). Planta Med 2014; 80 - P1L16, DOI: 10.1055/s-0034-1394674

Bras, T., Guerreiro, O., Duarte, M.F., Neves, L.A. Impact of extraction parameters and concentration by nanofiltration on the recovery of phenolic compounds from Cynara cardunculus var. altilis: Assessment of antioxidant activity. Industrial Crops and Products. 2015, 67: 137-142.

Guerreiro, O., Alves, S.P., Duarte, M.F., Bessa, R.J.B., Jerónimo, E. Cistus ladanifer L. shrub is rich in saturated and branched chain fatty acids and their concentration increase in Mediterranean dry season. Lipids. 2015, 50(5):493-501.

Guerra, A.R., Duarte, I.F., Duarte, M.F. Role of Isoprenoid Compounds on Angiogenic Regulation: Opportunities and Challenges. Current Medicinal Chemistry. 2016; 23(9):911-28.

Guerreiro O, Dentinho MTP, Moreira OC. Guerra AR, Ramos PAB., Bessa RJBB, Duarte MF, Jeronimo, E. 2016. Potencial of Cistus ladanifer L. (rockrose) in small ruminant diets - effect of season and plant age on chemical composition, in vitro digestibility and antioxidant activity. Grass and Forage Science, 71: 437–447.

Guerreiro, O., Alves, S. P., Costa, M., Cabo, A., Duarte M. F., Jerónimo E., Bessa R. J. B., 2016. Effects of extracts obtained from Cistus ladanifer L. on in vitro rumen biohydrogenation. Animal Feed Science and Technology, 219: 304–312.

Silva, F.S., Oliveira, P.J., Duarte, M.F. Oleanolic, Ursolic, and Betulinic Acids as Food Supplements or Pharmaceutical Agents for Type 2 Diabetes: Promise or Illusion? Journal of Agriculture and Food Chemistry. 2016, 20;64(15):2991-3008.

Ramos, P. A.B., Guerra, A.R., Guerreiro, O., Santos, S.A.O., Oliveira, H., Freire, C.S.R., Silvestre, A.J.D., Duarte, M.F. Antiproliferative effects of Cynara cardunculus L. var. altilis (DC) lipophilic extracts. International Journal of Molecular Sciences. 2017, 18,63; doi:10.3390/ijms18010063.

Alexandre, E.M.C., Araujo, P., Duarte, M.F., Freitas, V., Pintado,M., Saraiva, J.A.Experimental design, modelling and optimization of high pressure assisted extraction of bioactive compounds from pomegranate peel. Food and Bioprocess Technology 2017, 10(5), 886-900;  DOI 10.1007/s11947-017-1867-6

Ferro AM, Ramos P, Guerreiro O, Jerónimo E, Pires I, Capel C, Capel J, Lozano R, Duarte MF, Oliveira MM, Gonçalves S. Impact of novel SNPs identified in Cynara cardunculus genes on functionality of proteins regulating phenylpropanoid pathway and their association with biological activities. BMC Genomics, 2017 DOI 10.1186/s12864-0173534-8

O grupo dos Compostos Bioactivos centra a sua atividade na caracterização do potencial biológico de várias matrizes, nomeadamente resíduos agro-industriais e florestais, como estratégia de valorização integrada da biomassa permitindo a identificação e obtenção de produtos de elevado valor acrescentado.

O grupo tem-se dedicado em particular à avaliação da atividade anti-tumoral de determinados extratos e/ou respetivos compostos puros, num modelo de carcinogénese mamária. O grupo foca-se no estudo dos mecanismos celulares envolvidos nas diferentes respostas anti-tumorais promovidas por diferentes classes de compostos (fenólicos e lipofilicos), com especial interesse na remodelação vascular do tumor, mediada por determinados fatores de crescimentos, nomeadamente o fibroblast growth factor (FGF)1.

A maioria dos estudos realizados têm utilizado como matérias-primas a Cynara cardunculus e vulgarmente conhecida por cardo, e a casca do Eucalipto (Eucaliptus spp.). A caracterização do potencial biológico do bagaço de azeitona é também uma das áreas de interesse do grupo de investigação. Recentemente o grupo tem vindo a dedicar-se ao desenvolvimento de novas estratégias para o aumento da biodisponibilidade de ácidos triterpénicos, com reconhecida atividade biológica.

Uma outra área a que o grupo dos Compostos Bioactivos se tem dedicado, em estreita colaboração com o Grupo de Valorização dos Agro-Alimentos do CEBAL, é a caraterização do potencial de certas plantas endógenas, nomeadamente a Cistus ladanifer, vulgarmente conhecida por esteva, como estratégias nutricionais para pequenos ruminantes, no sentido de melhorar o valor nutricional de produtos derivados.

Membros do Grupo

Fátima Duarte   Investigadora Principal   Doutoramento em Ciências da Saúde    Universidade do Minho   Maine Medical Center Research Institute, USA           fatima.duarte@cebal.pt    Tel. + 351 284314399   Ext. 01023

Paula Parreira   Investigadora de Pós-Doutoramento                     Doutorada em Engenharia Biomédica   FCT/FEUP      paula.parreira@cebal.pt   Tel:+351 284 314 399   Ext. 01107

Ângela Guerra   Bolseira de Investigação Científica                        Mestre em Bioquímica   Universidade de Évora     angela.guerra@cebal.pt   Tel:+351 284 314 399   Ext. 01023

Patrícia Ramos   Estudante de Doutoramento                                  Licenciatura em Bioquímica   Universidade de Évora    patricia.ramos@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023

Olinda Guerreiro   Estudante de Doutoramento    Mestrado em Engenharia Alimentar                        Instituto Politécnico Beja    olinda.guerreiro@cebal.pt   Tel. +351 284314399   Ext. 01023

Ana Paulino   Mestrado em Engenharia do Ambiente                  IPB/ESA     Tel. + 351 284 314 399   Ext. 01023

Projetos Concluídos

2008 – “BIOECOS – Valorização Integrada da Biomassa” ALENT-09-0140-FEDER-000705 (QREN)

2009 - “REFINOLEA - Valorização integrada de resíduos da extracção de azeite" FCOMP-01-0202-FEDER-005450

2010 - "Removal of cytotoxic chemotherapy compounds from pharmaceutical/hospital wastewaters by combined membrane processing and advanced electro-oxidation treatment" as participant institution (PTDC/AAC-AMB/100960/2008).

2011 – “RITECA II - Rede de Investigação Transfronteiriça da Extremadura, Centro e Alentejo (Fase II)” (POCTEP)

2010 – “AFORE: Forest biorefineries: Added-value from chemicals and polymers by new integrated separation, fractionation and upgrading technologies”. Seventh Framework Programme FP7/2007-2013, FP7: CP-IP 228589-2 AFORE.

Projetos em curso

2011 - “NEW PROTECTION: Efeitos de estirpes probióticas em azeitonas em calda” (PTDC/AGR-ALI/117658/2010).

2013 – “NEucBark – New valorization strategies for Eucalyptus spp. Bark Extracts” (PTDC/AGR-FOR/3187/2012).

2013 – “Desenvolvimento da fileira da romã – Da planta ao bago pronto comer” (PRODER)

2014 – “MITIC – Modernización e innovación tecnológica con base TIC en sectores estratéicos y tradicionales” (POCTEP)

Publicações recentes

Mota, I., Pinto, P.C.R, Novo, C., Sousa, G., Guerreiro, O., Guerra, A., Duarte, M.F., and Rodrigues, A. E. Extraction of polyphenolic compounds from Eucalyptus globulus bark: process optimization and screening for biological activity. Industrial & Engineering Chemistry Research 2012; 51(20):6991-7000.

Tiburcio, M., Costa, M.A.S., Duarte, M., Schmitt F.C., Longatto Fillho, A. Characterization of PAR1 and FGFR1 Expression in Invasive Breast Carcinomas: Prognostic Significance. Oncology Letters 2012; (4):647-657.

Kirov, A., Duarte, M., Guay, J., Karolak, M., Yan, C., Oxburgh, L., and Prudovsky, I. Transgenic expression of nonclassically secreted FGF suppresses kidney repair. PLoS One. 2012;7(5):e36485. Epub 2012 May 14.

Velez, Z., Campinho, M.A., Guerra, A., Garcia, L., Ramos, P., Guerreiro, O., Felicio, L., Schmitt, F., Duarte, M. Biological Characterization of Cynara cardunculus L. Methanolic Extracts: Antioxidant, Anti-proliferative, Anti-migratory and Anti-angiogenic Activities. Agriculture 2012;2(4): 472-492.

Guerreiro, O., Velez, Z., Alvarenga, N., Matos, C., and Duarte, M. Molecular screening of ovine mastitis in different breeds. J Dairy Science. 2013; 96(2): 752-760.

Ramos, P., Santos, S.A.O., Guerra, A.R., Guerreiro, O., Felicio, L., Jerónimo, E., Silvestre, A.J.D., Neto, C.P., Duarte M. Valorisation of olive mill residues antioxidant and breast cancer antiproliferative activities of hydroxytyrosol-rich extracts derived from olive oil by-products. Industrial Crops and Products 2013; (46) 359-368.

Gomes, F.P., Silva, N., Trovatti, E., Serafim L.S., Duarte, M., Silvestre,A.J.D., Freire C.S.R. Production of Bacterial Cellulose by Gluconacetobacter sacchari using dry olive mill residue. Bioenergy and Biomass 2013;55:205-211.

Domingues, R.M.A., Guerra, A.R., Duarte, M., Freire, C.S.R., Neto, C.P., Silva, C.M.S., and Silvestre, A.J.D. Bioactive triterpenic acids: from agroforestry biomass residues, to promising therapeutic tools. Mini-Reviews in Organic Chemistry (in press).

Ramos, A.B.P., Guerra, A.R., Guerreiro, O., Freire, C.S.R., Silva, A.M.S., Duarte, M.F., and Silvestre, A.J.D. Lipophilic extracts of Cynara cardunculus L. var. altilis (DC): A source of valuable bioactive terpenic compounds. Journal of Agricultural and Food Chemistry 2013; 61(35):8420-8429.

O grupo de Genómica Agronómica incide a sua atividade de investigação no estudo de mecanismos moleculares relacionados com processos de desenvolvimento vegetal, pesquisa de novos genes e desenvolvimento de ferramentas biotecnológicas para a identificação/produção de plantas com características de interesse agronómico. O grupo tem em curso 2 linhas de investigação:

1. Formação da cortiça em sobreiro (Quercus suber)

O grupo está interessado no estudo do papel dos fatores de transcrição R2R3 MYB na regulação do processo de formação da cortiça em sobreiro. Um desses genes é o MYB1, previamente identificado como um gene regulatório candidato na formação da cortiça e tem vindo a ser estudado no grupo. Para além disso, está em curso o projeto de sequenciação do genoma do sobreiro. cujo objetivo é o conhecimento da sequência genómica do sobreiro.

2. Identificação/Produção de plantas de cardo (Cynara cardunculus) com produção aumentada de compostos do metabolismo secundário

O grupo desenvolve também trabalhos de investigação relacionados com o metabolismo secundário, incidindo na regulação das vias metabólicas dos compostos fenólicos e terpénicos em cardo, uma vez que diversos trabalhos têm mostrado esta espécie como uma fonte interessante de compostos com atividade biológica. O objetivo é desenvolver e aplicar ferramentas moleculares e de cultura in vitro para a identificação/produção de plantas de cardo com um maior conteúdo em metabolitos secundários com marcada atividade biológica.

O grupo também tem em curso o desenvolvimento de ferramentas para estudos funcionais, como a optimização da embriogénese somática de sobreiro (com criopreservação) e o estabelecimento de um sistema de transformação genética na mesma espécie.

Membros do Grupo

Sónia Gonçalves   Investigadora principal   Doutorada em Biologia   ITQB     sonia.goncalves@cebal.pt                      Tel: +351 284314399   Ext: 01026

Leandra Rodrigues   Investigadora de Pós-Doutoramento   Doutorada em Engenharia Agronómica   Instituto Superior de Agronomia     leandra.rodrigues@cebal.pt   Tel: +351 284314399   Ext: 01107/01105

Tânia Almeida   Investigadora de Pós-Doutoramento   Doutorada em Biologia     Universidade de Aveiro     tania.almeida@cebal.pt                                  Tel: +351 284319399   Ext: 01107/01105

Ana Ferro   Estudante de Doutoramento   Mestrado em Engenharia Alimentar                  Instituto Politécnico de Beja     ana.ferro@cebal.pt   Tel: +351 284319399   Ext: 01107/01105

Tiago Capote   Estudante de Doutoramento                            Mestrado em Bioquímica   Universidade da Beira Interior     tiago.capote@cebal.pt   Tel: +351 284319399   Ext: 01107/01105

Sara Valente   Bolseira de Investigação   Mestrado em Ecologia e Gestão Ambiental        Faculdade de Ciências de Lisboa     sara.valente@cebal.pt   Tel: +351 284319399   Ext: 01107/01105

André Folgado   Bolseiro de Investigação   Mestrado em Biologia Celular e Biotecnologia    Faculdade de Ciências de Lisboa     andre.folgado@cebal.pt   Tel: +351 284319399   Ext: 01107/01105

Projetos concluídos

2009 - “Consórcio de ESTs do Sobreiro - Stress Biótico” SOBREIRO/0014/2009

2009 - “Consórcio de ESTs do Sobreiro - Qualidade da cortiça” SOBREIRO/0038/2009

2009 - “Consórcio de ESTs do Sobreiro - Produção da cortiça” SOBREIRO/0017/2009

2009 - “Transcriptómica da embriógenese do pinheiro bravo” PTDC/AGR-GPL/102877/2008

2009 - “Redes de regulação da expressão génica - actividade do felogénio” PTDC/AGR-GPL/098369/2008

Projetos em curso

2011 - "Phellogen development & stress response in cork oak” PTDC/AGR-GPL/118856/2010

2012 - Genosuber - Sequenciação do genoma do sobreiro. ALENT-07-0224-FEDER-001754 

Publicações recentes

Pereira-Leal JB, Abreu IA, Alabaça CA, Almeida MH, Almeida P, Almeida T,et al (2014) A comprehensive assessment of the transcriptome of cork oak (Quercus suber) through EST sequencing. BMC Genomics 15:371 http://www.biomedcentral.com/1471-2164/15/371

Almeida T, Pinto G, Correia B, Santos C, Gonçalves S (2013) QsMYB1 expression is modulated in response to heat and drough stresses and during plant recovery in Quercus suber. Plant Physiology and Biochemistry 73: 274-281 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24161757

Almeida T, Menéndez E, Capote T, Ribeiro T, Santos C, Gonçalves S (2013) Molecular characterization of Quercus suber MYB1, a transcription factor up-regulated in cork tissues. Journal of Plant Physiology 170: 172– 178 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23218545

As tecnologias genómicas e moleculares são dos instrumentos mais avançados, que contribuem para melhorar a produtividade e a qualidade dos recursos genéticos vegetais, a sustentabilidade da agricultura e silvicultura e a conservação da biodiversidade vegetal. A atividade de investigação do grupo Genómica Agronómica incide no desenvolvimento de ferramentas de biotecnologia, ao nível da genética molecular e da propagação in vitro de espécies vegetais, como o sobreiro (Quercus suber) e o cardo (Cynara cardunculus), e em novas culturas, como a amendoeira (Prunus dulcis).

Linhas de investigação:

1. Biologia do desenvolvimento Vegetal

Estudos de desenvolvimento vegetal que permitam compreender e aprofundar a base genética da formação e qualidade da cortiça, da produção de compostos bioactivos no cardo, tal como da produção e qualidade da amêndoa.

2. Estratégias de Melhoramento Vegetal Molecular

Com recurso a ferramentas genómicas o desenvolvimento de estratégias que englobam a caracterização da diversidade genética de populações naturais e cultivares, a identificação e seleção de plantas com elevado valor acrescentado com recurso a marcadores moleculares, propagação in vitro de variedades ou genótipos de interesse previamente selecionados.

3. Despiste de doenças em material vegetal

Com o auxílio de técnicas moleculares, a atividade incide no despiste de algumas doenças em material vegetal de propagação, como o caso de viroses de amendoeira.

Projetos Mestrado 

Para consultar os projetos de mestrado disponivels clique aqui.

Membros do Grupo

Liliana Marum (CV)   Investigadora principal   Doutorada em Biologia   Instituto de Tecnologia Química e Biológica (ITQB)     liliana.marum@cebal.pt                      Tel: +351 284314399

Ana Paulino (CV)   Estudante de Doutoramento   Mestrado em Engenharia do Ambiente                  IPB/ESA     ana.paulino@cebal.pt   Tel. + 351 284 314 399   Ext. 01023/01105

Rita Pires (CV)   Bolseira de Investigação Científica                         Mestrado em Química Forense                 Universidade de Coimbra      rita.pires@cebal.pt   Tel: +351 284319399   Ext: 01107/01105

Ana Luisa Faustino (CV)   Bolseira de Investigação Científica                           Mestrado em Bioquímica   Universidade de Coimbra                              ana.faustino@cebal.pt   Tel: +351 284319399   Ext: 01107/01105

Gonçalo de Almeida (CV)   Estudante de Mestrado                       Licenciado em Biologia   Instituto Superior de Agronomia (ISA), Lisboa                Tel: +351 284319399   Ext: 01107/01105

Sandra Caeiro (CV)   Estudante de Mestrado                                          Lienciada em Biologia   Universidade de Évora         Tel: +351 284319399   Ext: 01107/01105

Ex-membros

Sergio João, MSc

Joana Serôdio, MSc

Tiago Capote, PhD

Ana Ferro, PhD

Bárbara Correia, MSc

Sónia Gonçalves, PhD

André Folgado, MSc

Leandra Rodrigues, PhD

Sara Valente, MSc

Tánia Almeida, PhD

Projetos em Cursos

2020 – Inov-Amendo-AL: Inov-Amendo-AL : Microenxertia in vitro de amendoeiras selecionadas para a promoção do amendoal no Alentejo (ALT20-03-0246-FEDER-000068)

2019 – MedCyanaraBioTec: Seleção de Genótipos de Cynara cardunculus para Novas Aplicações Biotecnológicas: potenciar a cadeia de valor do cardo, uma cultura mediterrânica bem adaptada (ALT20-03-0145-FEDER- 039495)

Projetos Concluídos

2015 - 2019: Lentidev: Uma abordagem molecular da cortiça à porosidade da cortiça” (ALT20-03-0145-FEDER-000020)

2015 - 2018: ValBioTecCynara: “Valorização económica do cardo (Cynara cardunculus): variabilidade natural e suas aplicações biotecnológicas” (ALT20-03-0145- FEDER-000038)

2016 – 2022: SelectPinea: “Desenvolvimento de marcadores genéticos para características de interesse em pinheiro manso (Pinus pinea)” (ALT20-03-0145-FEDER-000041)

2016 - 2020: HydroReuse: “Tratamento e reutilização de águas residuais agroindustriais utilizando um sistema hidropónico inovador com plantas de tomate” (ALT20-03-0145-FEDER-000021)

2012 – 2015: “Genosuber - Sequenciação do genoma do sobreiro” ALENT-07-0224-FEDER-001754

2011 - "Phellogen development & stress response in cork oak” PTDC/AGR-GPL/118856/2010

2009 - “Consórcio de ESTs do Sobreiro - Stress Biótico” SOBREIRO/0014/2009

2009 - “Consórcio de ESTs do Sobreiro - Qualidade da cortiça” SOBREIRO/0038/2009

2009 - “Consórcio de ESTs do Sobreiro - Produção da cortiça” SOBREIRO/0017/2009

2009 - “Transcriptómica da embriógenese do pinheiro bravo” PTDC/AGR-GPL/102877/2008

2009 - “Redes de regulação da expressão génica - actividade do felogénio” PTDC/AGR-GPL/098369/2008

Publicações recentes

Marum L, Nunes S, Almeida T, Pereira VT, Farinha N, Dias MC, Santos C (2018). Cryopreservation of hybrid Pinus elliottii x P. caribaea; In “Stepwise protocols for somatic embryogenesis of woody plants”; S. Mohan Jain and Pramod K. Gupta (Eds), 2nd edition, Springer Verlag. Vol. 84, 283-294.

Nunes S., Sousa D., Pereira V.T., Correia S., Marum L., Santos C., Maria C. Dias (2018) Efficient protocol for in vitro mass micropropagation of Slash Pine; In Vitro Cellular & Developmental Biology – Plant, 54: 175. DOI 10.1007/s11627-018-9891-4.

Capote T, Usié A, Barbosa P, Ramos AM, Morais-Cecílio L, Gonçalves S. (2018) Transcriptome dynamics of cork oak (Quercus suber) somatic embryogenesis reveals active gene players in transcription regulation and hormone homeostasis of embryo development. Tree Genetics & Genomes, 15(4), doi: 10.1007/s11295-019-1353-6.

Capote T, Barbosa P, Usié A, , Ramos AM, Inácio V, Gonçalves S, Morais-Cecílio L. (2018) Chip-Seq reveals that QsMYB1 directly targets genes involved in lignin and suberin biosynthesis pathways in cork oak (Quercus suber). BMC Plant Biology, 18: 198. doi: 10.1186/s12870-018-1403-5.Sandra Nunes S., Marum L., Nelson Farinha N., Pereira V.T., Almeida T., Sousa D., Mano N., Figueiredo J., Dias M.C., Santos C. (2017) Somatic embryogenesis of hybrid Pinus elliottii var. elliottii × P. caribaea var. hondurensis and ploidy assessment of somatic plants; Plant Cell Tiss Organ Cult, 132:71–84, DOI 10.1007/s11240-017-1311-7.

Nunes S., Marum L., Farinha N., Pereira V.T., Almeida T., Dias C.D., Santos C. (2017) Plant regeneration from ploidy-stable cryopreserved embryogenic lines of the hybrid Pinus elliottii x P. caribaea; Industrial Crops and Products,105: 215–224.

Ferro AM, Ramos P, Guerreiro O, Jerónimo E, Pires I, Capel C, Capel J, Lozano R, Duarte MF, Oliveira MM, Gonçalves S (2017). Impact of novel SNPs identified in Cynara cardunculus genes on functionality of proteins regulating phenylpropanoid pathway and their association with biological activities. BMC Genomics, 18(1):183 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/28212611

Pereira-Leal JB, Abreu IA, Alabaça CA, Almeida MH, Almeida P, Almeida T ,et al (2014) A comprehensive assessment of the transcriptome of cork oak (Quercus suber) through EST sequencing. BMC Genomics 15:371 http://www.biomedcentral.com/1471-2164/15/371.

Almeida T, Pinto G, Correia B, Santos C, Gonçalves S (2013) QsMYB1 expression is modulated in response to heat and drough stresses and during plant recovery in Quercus suber. Plant Physiology and Biochemistry 73: 274-281 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24161757.

Almeida T, Menéndez E, Capote T, Ribeiro T, Santos C, Gonçalves S (2013) Molecular characterization of Quercus suber MYB1, a transcription factor up-regulated in cork tissues. Journal of Plant Physiology 170: 172– 178 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23218545.

Em atualização.